Наконец сделал скрипт для транслитерации кириллицы в латиницу по правилам Роспатента. См.по ссылке скрипт транслитерации.

Автор скрипта мне, к сожалению, не известен. В скрипт легко внести изменения в части правил транслитерации, чем он и хорош, поскольку ни одной приемлемой для работы программы транслитерации мне найти не удалось.

Конвертировать можно одно или несколько слов, в том числе начинающихся с заглавных букв. Возможно использование буфера обмена. Во всех случаях буква "Й" транслитерирует как "J". Заглавные буквы транслитерируются как заглавные, при этом в случае транслитерации заглавной русской буквы несколькими буквами латинского алфавита, сочетание латинских букв будет начинаться с заглавной латинской буквы. Буква "Ё" во всех случаях транслитерируется как "E". Буква "Ъ" опускается во всех случаях.

Исходная таблица с правилами транслитерации Роспатента (по состоянию на 30.07.2009).